故事發(fā)生在距現(xiàn)在不遠(yuǎn)的未來(lái)，我們?nèi)祟?lèi)所了解的世界看上去并沒(méi)有發(fā)生太大的變化，但是近來(lái)世界各地不斷有“異生獸”作亂的報(bào)告。為了暗中解決這個(gè)問(wèn)題，成立了世界性的防衛(wèi)組織TLT。他的日本支部被稱(chēng)為T(mén)LT-J。而TLT-J的下屬組織就是夜襲隊(duì)NR(Night Raider)。他們的任務(wù)就是秘密的消滅異生獸。新的敵人異生獸突然出現(xiàn)在擁有驕人戰(zhàn)績(jī)的夜襲隊(duì)面前，他們陷入了苦戰(zhàn)。這時(shí)，光之巨人奈克瑟斯奧特曼登場(chǎng)了。奈克瑟斯奧特曼的適能者·姫矢準(zhǔn)也出現(xiàn)了。奈克瑟斯利用相位的褶曲，制造出屬于自己的戰(zhàn)斗空間“美塔領(lǐng)域”。他在巨大化后，將異生獸拉到這個(gè)空間內(nèi)進(jìn)行戰(zhàn)斗。而且，ＴＬＴ的特殊飛行器合體后也可以進(jìn)入這個(gè)空間，與奈克瑟斯一起作戰(zhàn)。TLT的新隊(duì)員，孤門(mén)一輝(川久保拓司 飾)，與和倉(cāng)隊(duì)長(zhǎng)以及其他的隊(duì)員一起處理著繁忙的任務(wù)。可是自從他遇到姬矢準(zhǔn)(桐島優(yōu)介 飾)后便對(duì)自己的任務(wù)已經(jīng)周?chē)沫h(huán)境產(chǎn)生了疑問(wèn)。組織究竟隱藏著怎樣的秘密、隊(duì)員們的過(guò)去又是如何的、奈克瑟斯和異生獸的原形到底是什么？???孤門(mén)和姬矢準(zhǔn)建立了深厚地友誼，并一步步地開(kāi)始揭開(kāi)謎底。