吳明泰(馬躍 飾)得知世界化學(xué)年會因抵制德國改為慕尼黑復(fù)會的消息時，他再次振作起來，拿起手中的筆。

中川洋子(徐筠 飾)逃回北平，逼迫著化學(xué)家張琴(秦麗 飾)前往關(guān)東軍化學(xué)部隊，一心尋死的張琴被吳明安(王同輝 飾)救下卻被日軍押往軍營。

而昆明的小鎮(zhèn)上，軍統(tǒng)傾巢出動，向舒立娟(王雅捷 飾)撲來，當(dāng)吳明泰、舒立娟被保護(hù)他們的老僧藏進(jìn)山洞時，洞外軍統(tǒng)的子彈卻射向眾僧，忍無可忍的吳明泰沖出山洞，不料，舒立娟卻用身體擋住了他沖出洞外，然而，就在她企圖把軍統(tǒng)引開時，而吳明泰卻倒在血泊中。

幾條黑影蹬上了峭壁，胡思良的小分隊星夜趕到，然而，當(dāng)他們沖進(jìn)寺廟時看到的只是奄奄一息的吳明泰，胡思良明白，軍統(tǒng)搶在前面抓走了舒立娟并奪去了吳明泰重要的手稿。情況危急，齊遠(yuǎn)(陳曦 飾)背起吳明泰設(shè)法急救，胡思良等人向軍統(tǒng)逃走的方向追去。

果然，葛站長(蔣昌義 飾)以點(diǎn)燃吳明泰的手稿威脅舒立娟，她只能“順從”接受審訊。猛然，一支槍逼住了丁青山(孫一理 飾)，胡思良等人閃電般的闖進(jìn)，迅雷不及掩耳制服了軍統(tǒng)人員。然而，當(dāng)舒立娟毅然獨(dú)自前往意大利揭露日軍罪行時，卻流淌著淚水遲遲不肯離去，她唯一惦念的仍是吳明泰。

北平，吳明安忍氣吞聲的應(yīng)付著鈴木，誰料，日本人卻肆意欺辱著華夏學(xué)人，田教授奮起反抗，卻被日軍官當(dāng)眾擊斃，文教授上前相救卻被日軍侮辱，師生們再也無法忍受日軍禽獸般的行徑，集體抗議卻被抓入牢房。吳明安痛罵日軍，鈴木卻“悲痛”地告知張琴已死在關(guān)東軍，吳明安崩潰了，然而，鈴木卻強(qiáng)令他娶另一個日本女子山美惠子。